El 18 de octubre de 1698 presento informaciones de
nobleza y limpieza de sangre siendo admitido en el Colegio Mayor como colegial
porcionista. En 1699 obtuvo la beca de Tunja lo cual le acredito como colegial
formal, durante el segundo rectorado de Cristobal Torres Bravo.
En 1702, bajo el primer rectorado de Jacinto Roque
Florez de Acuña, Fernando Antonio es nombrado conciliario colegial. Y bajo su
segundo rectorado, 1708-1710, Fernando Antonio es nombrado vicerrector.
En 1707, con el titulo de doctor, se presento como
opositor para obtener la catedra de visperas de sagrada teologia. En ese mismo
año tambien ejercio como catedratico de artes, fue comisario apostolico y
subdelegado generalde la santa cruzada. En 1704, catedratico de artes hasta
1710, año en que fue ordenado sacerdote y entro al clero secular como
presbitero. Cura del pueblo de Gameza. Desde 1711 hasta 1714 fue rector por
primera vez. Siendo posteriormente catedratico hasta el año 1728 en el cual fue
nombrado nuevamente rector del Colegio Mayor hasta 1733.
Al finalizar su segundo rectorado, el 23 de octubre
de 1733, Fernando Antonio logro cumplir uno de los deseos del fundador, siendo
esta, que se dictara la primera catedra de medicina.
Aparentemente murio en el año 1753 cuando se
disponia a viajar a Santa Marta a ocupar el cargo de obispo.
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